大庆医学高等专科学校临床医学系现有教职工24人，副高级以上职称8人，其中教授1人、主任医师1人，副教授5人、副主任医师1人；硕士研究生13人，在读博士研究生1人、在读硕士研究生3人。下设内儿、外妇、预防和口腔4个教研室，承担着临床医学、口腔医学、口腔医学技术和医学营养4个专业的专业建设和学生管理工作。目前建有校内仿真临床医学、口腔医学、口腔医学技术、医学营养专业实训中心，校外实习基地20余家。在专业建设、教学改革、师资队伍建设和科教研等方面均取得了丰硕成果。

临床医学专业是我校成立最早的专业，从1965年开始招生，目前是黑龙江省骨干高职院校重点建设专业和中央财政支持建设专业，多年来为油田及全国各地输送了上万名高素质的医务工作者。专业旨在培养学生熟练掌握医学基础理论和临床医学知识，具有分析问题和解决问题的能力，具有良好的职业道德、人文素养、实践能力、创新意识和团队协作精神，毕业后能够在基层医疗卫生机构从事常见病、多发病的诊疗、预防保健、计划生育、健康教育与咨询等工作的高素质技术技能型专门人才。从2011年起与福建乡镇卫生院签订“订单就业”，每年输送毕业生20人左右。又与嫩江民生医院，浙江东阳红十字会医院，签订“定向就业”。按照学校“办好专科、办出特色”的总体要求，坚持以服务为宗旨、以就业为导向，走产学研结合的发展道路，以提高质量为核心，创新体制机制，校企合作、工学结合、订单培养，遵循职业教育“四对接”原则，全面提升专业建设水平，发挥引领示范作用。